João Marques foi o primeiro reforço anunciado pelo Sp. Braga para 2024/25, mas está a tardar em ganhar o seu espaço na equipa. A escassa utilização não estaria nos seus planos, depois de ter sido anunciado com pompa logo no início de fevereiro como contratação para 5 anos, a troco de 3,5 milhões de euros pagos ao Estoril, onde ficou a competir até final da última época.