Rui Moreira recebeu de braços abertos a nova direção do FC Porto e a administração da SAD lideradas por André Villas-Boas, prometendo total colaboração, lembrando que foi assim que sempre pautou a sua governação na cidade Invicta ao longo de 11 anos.

No entanto, fruto de alguns comentários a propósito da equipa e do funcionamento do clube na época passada, Rui Moreira foi criticado pela anterior liderança, o que levou a um afastamento. O edil portuense não compreendeu a situação, recordando que tem direito à opinião.

"É normal que o presidente da Câmara do Porto, enquanto cidadão e enquanto sócio do FC Porto, umas vezes ache que as coisas estão bem, e noutras ache que estão mal. Recordo-vos que houve um vice-presidente do FC Porto, da anterior direção, o doutor Fernando Gomes, que tomou parte ativa na anterior campanha eleitoral e achei isso perfeitamente normal. Daí não veio mal ao mundo. Chegou a dizer que eu era pior presidente do que o doutor Rui Rio. É um direito que ele tem. Eu também tenho direito, enquanto pessoa, de ter a minha opinião sobre as coisas que se passam dentro do FC Porto, separando, como é evidente, as águas enquanto presidente da Câmara", rematou.